Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RNF148Q8N7C7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF148Q8N7C7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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