Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC17Q8N6Y2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC17Q8N6Y2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC17Q8N6Y2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC17Q8N6Y2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC17Q8N6Y2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC17Q8N6Y2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC17Q8N6Y2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC17Q8N6Y2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC17Q8N6Y2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC17Q8N6Y2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC17Q8N6Y2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRRC17Q8N6Y2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC17Q8N6Y2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC17Q8N6Y2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC17Q8N6Y2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRRC17Q8N6Y2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LRRC17Q8N6Y2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LRRC17Q8N6Y2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms