Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMCO5AQ8N6Q1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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TMCO5AQ8N6Q1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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TMCO5AQ8N6Q1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCO5AQ8N6Q1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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