Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN19Q8N6F1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN19Q8N6F1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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