Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
IGSF1Q8N6C5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
IGSF1Q8N6C5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms