Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5C6

SRBD1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 995 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRBD1Q8N5C6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRBD1Q8N5C6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRBD1Q8N5C6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SRBD1Q8N5C6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRBD1Q8N5C6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRBD1Q8N5C6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRBD1Q8N5C6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRBD1Q8N5C6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRBD1Q8N5C6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRBD1Q8N5C6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRBD1Q8N5C6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SRBD1Q8N5C6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRBD1Q8N5C6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRBD1Q8N5C6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRBD1Q8N5C6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRBD1Q8N5C6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRBD1Q8N5C6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRBD1Q8N5C6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRBD1Q8N5C6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SRBD1Q8N5C6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRBD1Q8N5C6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRBD1Q8N5C6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRBD1Q8N5C6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRBD1Q8N5C6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms