Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SVOPQ8N4V2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SVOPQ8N4V2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms