Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCML4Q8N228 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML4Q8N228 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms