Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYK2

CCDC105, Coiled-coil domain-containing protein 105, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC105Q8IYK2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC105Q8IYK2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC105Q8IYK2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC105Q8IYK2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC105Q8IYK2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC105Q8IYK2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC105Q8IYK2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC105Q8IYK2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC105Q8IYK2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC105Q8IYK2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC105Q8IYK2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC105Q8IYK2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC105Q8IYK2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC105Q8IYK2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC105Q8IYK2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms