Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ5

TRIM42, Tripartite motif-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM42Q8IWZ5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms