Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ5

TRIM42, Tripartite motif-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM42Q8IWZ5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM42Q8IWZ5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM42Q8IWZ5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms