Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM8

SLC22A9, Solute carrier family 22 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A9Q8IVM8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC22A9Q8IVM8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC22A9Q8IVM8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms