Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNGA4Q8IV77 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA4Q8IV77 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms