Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TREML1Q86YW5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TREML1Q86YW5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms