Protein–RNA interactions for Protein: Q86YP4

GATAD2A, Transcriptional repressor p66-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2AQ86YP4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GATAD2AQ86YP4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GATAD2AQ86YP4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GATAD2AQ86YP4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GATAD2AQ86YP4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms