Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RASSF3Q86WH2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms