Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU7

SETD3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD3Q86TU7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD3Q86TU7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD3Q86TU7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SETD3Q86TU7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD3Q86TU7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD3Q86TU7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD3Q86TU7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD3Q86TU7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD3Q86TU7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD3Q86TU7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD3Q86TU7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD3Q86TU7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SETD3Q86TU7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SETD3Q86TU7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SETD3Q86TU7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SETD3Q86TU7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SETD3Q86TU7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SETD3Q86TU7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SETD3Q86TU7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SETD3Q86TU7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SETD3Q86TU7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD3Q86TU7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD3Q86TU7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD3Q86TU7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD3Q86TU7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD3Q86TU7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD3Q86TU7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD3Q86TU7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SETD3Q86TU7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD3Q86TU7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD3Q86TU7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD3Q86TU7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD3Q86TU7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD3Q86TU7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD3Q86TU7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD3Q86TU7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD3Q86TU7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD3Q86TU7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD3Q86TU7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SETD3Q86TU7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms