Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00523Q86TU6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINC00523Q86TU6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC00523Q86TU6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms