Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NPM2Q86SE8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NPM2Q86SE8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms