Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRAPQ7Z569 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRAPQ7Z569 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRAPQ7Z569 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRAPQ7Z569 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BRAPQ7Z569 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BRAPQ7Z569 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms