Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
USP43Q70EL4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
USP43Q70EL4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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