Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00173Q6ZV60 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms