Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT9

DENND5B, DENN domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND5BQ6ZUT9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DENND5BQ6ZUT9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DENND5BQ6ZUT9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND5BQ6ZUT9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND5BQ6ZUT9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND5BQ6ZUT9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND5BQ6ZUT9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND5BQ6ZUT9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND5BQ6ZUT9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND5BQ6ZUT9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND5BQ6ZUT9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND5BQ6ZUT9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND5BQ6ZUT9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND5BQ6ZUT9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND5BQ6ZUT9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND5BQ6ZUT9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND5BQ6ZUT9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND5BQ6ZUT9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND5BQ6ZUT9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND5BQ6ZUT9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND5BQ6ZUT9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND5BQ6ZUT9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND5BQ6ZUT9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND5BQ6ZUT9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms