Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC149Q6ZUS6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms