Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC129Q6ZRS4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC129Q6ZRS4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms