Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRCAPQ6ZRS2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRCAPQ6ZRS2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRCAPQ6ZRS2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms