Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDZRN4Q6ZMN7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZRN4Q6ZMN7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms