Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C12orf54Q6X4T0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms