Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATRAIDQ6UW56 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms