Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4L9Q6RFH8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4L9Q6RFH8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4L9Q6RFH8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4L9Q6RFH8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4L9Q6RFH8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4L9Q6RFH8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4L9Q6RFH8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4L9Q6RFH8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4L9Q6RFH8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4L9Q6RFH8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4L9Q6RFH8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4L9Q6RFH8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4L9Q6RFH8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4L9Q6RFH8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUX4L9Q6RFH8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUX4L9Q6RFH8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUX4L9Q6RFH8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUX4L9Q6RFH8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUX4L9Q6RFH8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUX4L9Q6RFH8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DUX4L9Q6RFH8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DUX4L9Q6RFH8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms