Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBA3EQ6PEY2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TUBA3EQ6PEY2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms