Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMBQ6PCB8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms