Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPP4R4Q6NUP7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP4R4Q6NUP7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms