Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC144NLQ6NUI1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms