Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DUPD1Q68J44 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUPD1Q68J44 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms