Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALS2CLQ60I27 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALS2CLQ60I27 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms