Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD13Q5VXD3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD13Q5VXD3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms