Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCERG1LQ5VWI1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCERG1LQ5VWI1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCERG1LQ5VWI1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms