Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GFI1BQ5VTD9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GFI1BQ5VTD9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms