Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
OBSCNQ5VST9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms