Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRTP1Q5TC63 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRTP1Q5TC63 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRTP1Q5TC63 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms