Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C1orf220Q5T0J3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf220Q5T0J3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf220Q5T0J3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms