Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCID2Q5JVF3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCID2Q5JVF3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCID2Q5JVF3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms