Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF542PQ5EBM4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.7 ms