Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRDTQ58F21 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BRDTQ58F21 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRDTQ58F21 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms