Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDK2Q58EX2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SDK2Q58EX2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms