Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1BQ53T94 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1BQ53T94 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms