Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF394Q53GI3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF394Q53GI3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms