Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHLDA2Q53GA4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PHLDA2Q53GA4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms