Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RFTN2Q52LD8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFTN2Q52LD8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms