Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC1Q4ZHG4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNDC1Q4ZHG4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms